Normalmente, as células fazem reciclagem ou renovação de seus componentes por processos que permitem a degradação controlada de proteínas e de organelas envelhecidas. Nesse sentido, há dois mecanismos principais: degradação protéica nos proteassomos e autofagia. Ambos são importantes, por exemplo, durante o desenvolvimento embrionárioe a diferenciação dos tecidos. Em células diferenciadas, os dois processos são operados de modo muito regulado.
Os proteassomos são agregados macromoleculares em forma de barril que contêm proteases capazes de agir sobre várias proteínas. A proteólisenos proteassomos requer ubiquitinização , a qual depende de enzimas chamadas ubiquitina ligases, que ligam várias moléculas de ubiquitina a proteína a ser degradada, facilitando a entrada desta nos proteassomos.
Já a autofagia,significa alimentar-se de si mesmo, é um processo ativo no qual a célula envolve partes de suas estruturas lesadas ou envelhecidas ou agregados de proteínas alteradas e forma um vacúolo autofágico ,que se funde a lisossomos para a digestão das estruturas sequestradas.
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